Рефераты. Клонирование и анализ генов легких цепей иммуноглобулинов стерляди

вариабельные домены, объединяются в различных сочетаниях, образуя матрицу

для экспрессии L- и H-цепей (Seidman et al., 1979; Durdik et al., 1984).

ГЕНОМНАЯ ОРГАНИЗАЦИЯ И ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ L-ЦЕПЕЙ ИГ У МЛЕКОПИТАЮЩИХ

Различные виды млекопитающих имеют сходную схему организации и

экспрессии генов ИГ. Одним из наиболее изученных в этом отношении видов

является человек. Лямбда и каппа цепи ИГ у человека кодируются генами,

расположеными в разных локусах и на разных хромосомах. Каппа локус состоит

из большого количества V( генных сегментов, собраных в группы, пяти J( и

одного С( сегмента.. Такой тип организации называется сегментарным (рис.

2). Лямбда локус состоит из группы V( сегментов, точное количество которых

неизвестно, и семи пар J(-C( сегментов. Три из них (JC(4 - JC(6) являются

псевдогенами (Hieter et al., 1981; Roitt et al., 1993).

В процессе развития В-лимфоцита в кроветворных органах один из V

сегментов соединяется с одним из J сегментов посредством сайтспецифической

рекомбинации (Schatz et al., 1992). В этот процесс вовлекаются специальные

олигомерные последовательности: гепта- и нонамеры, фланкирующие с 3'

стороны V сегмент и с 5' стороны J сегмент (рис. 3) (Aguilera et al., 1987;

Hesse et al., 1989). Отличительной особенностью лямбда и каппа локусов

является конфигурация промежутков между гепта- и нонамерами, называемых

спейсерами. С V и J генными сегментами лямбда типа ассоциированы 23 пн и 12

пн спейсеры соответственно, а с V и J сегментами каппа типа - 12 пн и 23 пн

спейсеры (Durdik et al., 1984; Stavnezer et al., 1985).

л

Рис. 2. Схема строения лямбда и каппа локусов генов L-цепей ИГ

человека.

Лямбда локус содержит много V( сегментов и семь пар

близкорасположенных J(-C(. Три из них яляюся псевдогенами ((). Каппа локус

содержит много V( пять J( и один C( генный сегмент (Hieter et al., 1981;

Roitt et al., 1993).

Обозначения: - сигнальные олигомеры.

Рис. 3. Схема расположения олигонуклеотидных последовательностей,

задействованных в сайтспецифической рекомбинации в каппа локусе

млекопитающих. Эти последовательности фланкируют с 3‘ стороны VL сегмент и

с 5’ стороны JL сегмент. Во время рекомбинации гептамер и нонамер одного из

VL сегмента объединяются с гептамером и нонамером одного из JL сегмента.

Это делает возможным соединение VL и JL сегментов без нарушения рамки

трансляции (Aguilera et al., 1987; Hesse et al., 1989).

Обозначения: - сигнальные олигомеры.

Последовательность, в которой рекомбинируют локусы L-цепей, строго

упорядочена во времени. Показано, что первыми перестраиваются локусы каппа

типа, причем если в одной хромосоме перестройка оказалась нефункциональной,

тоесть не привела к появлению полноценного гена, то рекомбинация происходит

в каппа локусе на гомологичной хромосоме. В случае повторной абортивной

перестройки аналогично происходят перестройки в лямбда локусах. Если в

клетке непродуктивно перестроились все четыре локуса, то она превращатся в

0-клетку и подвергается апоптозу. Если же перестройка одного из локусов

привела к образованию функционального гена, то рекомбинация остальных

локусов блокируется. Детали механизма блокирования неизвестны, однако

установлено, что необходимым условием для него является транскрипция

продуктивно перестроенного гена. В результате в каждом индивидуальном

лимфоците синтезируется только один тип L-цепей, каппа или лямбда, и

экспрессия гена происходит только на одной из двух гомологичных хромосом.

Эти феномены, называемые изотипическим и аллельным исключениями лежат в

основе ключевого принципа функционирования иммунной системы - принципа

клональной селекции (Пол, 1987; Strob, 1987).

В организме млекопитающих генерируется свыше десяти миллионов

вариантов антител, хотя в геноме содержится значительно меньшее количество

генных сегментов, которые могут участвовать в формировании вариабельных

доменов. В случае L-цепей, основным источником разнообразия является

комбинативное сочетание V и J сегментов. Дополнительным источником является

смещение рекомбинационной рамки в месте их соединения. Кроме того, V генные

сегменты могут обмениваться участками ДНК с псевдогенами посредством генной

конверсии. Очень существенный вклад в разнообразие специфичностей антител

вносит соматическое мутирование вариабельных генных сегментов в сайтах,

участвующих в формировании антигенсвязывающего центра. Соматическое

разнообразие генерируется при вторичном иммунном ответе путем включения

гипермутационного механизма в клетках памяти в зародышевых центрах

лимфатических узлов (Tonegawa 1983; Roitt et al., 1993).

ГЕНОМНАЯ ОРГАНИЗАЦИЯ И ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ L-ЦЕПЕЙ ИГ У НИЗШИХ

ПОЗВОНОЧНЫХ

Хрящевые рыбы.

Гуморальный иммунный ответ в виде специфических антител

обнаруживается только у позвоночных. Наиболее примитивными видами, у

которых обнаружена способность синтезировать ИГ, являются хрящевые рыбы.

Представители трех основных таксонов (акулы, скаты и химеры) продуцируют

антитела в ответ на введение широкого спектра антигенов. Однако, в отличие

от млекопитающих, гетерогенность сывороточных антител у хрящевых рыб

выражена очень слабо. Кроме того, у них не обнаружено созревание иммунного

ответа - при вторичном введении антигена спектр антител не меняется

(Flajnik, 1996). Результаты исследований последних лет продемонстрировали,

что организация генов ИГ у хрящевых рыб также имеет ярко выраженные

особенности.

У хрящевых рыб обнаружены гены трех типов L-цепей, локализующиеся в

разных локусах. В каждом локусе геные сегменты организованы в кластеры,

имеющие по одному V, J и C генному сегменту (рис. 4). Таких кластеров

содержится несколько десятков или даже сотен в одном локусе на расстоянии

12-15 тпн друг от друга (Rast et al., 1994).

Гены первого типа найдены у разнозубой акулы (Heterodontus francisci)

(Shamblott and Litman, 1989) и малого ската (Raja erinacea) (Anderson et

al., 1995). У акулы кластеры имеют размер 3-6 тпн. V и J, J и C генные

сегменты разделены примерно 0,5 и 4 тпн соответственно. У ската V и J

сегменты слиты в зародышевой ДНК.

Гены второго типа обнаружены у пятнистой химеры (Hydrolagus colliei)

(Maisey, 1984), песчаной акулы (Carcharhinus plumbeus) (Hohman et al.,

1992; Hohman et al., 1993), разнозубой акулы и малого ската (У всех

изученных видов в кластерах этого типа V и J генные сегменты соединены уже

в зародышевом геноме. V и C гeнные сегменты разделены 2-3 тпн.

Рис. 4. Схема строения локусов генов L-цепей ИГ у акулы.

Организация генов у акулы имеет кластерный тип. Каждый кластер имеет

размер 3 - 6 тпн и содержит по одному VL, JL и CL генному сегменту.

Обнаружено три типа генов L-цепей ИГ. Локусы генов первого и третьего

типов имеют схожую организацию. В этом случае VL и JL, JL и CL сегменты

разделены примерно 0,5 и 4 тпн соответственно (А) (Rast et al., 1994).

В локусе генов второго типа VL и JL сегменты соединены уже в

зародышевом геноме (Б).

Третий тип генов L-цепей найден у акулы-няньки (Gynglimostoma

cirratum) (Greenberg et al., 1993) и разнозубой акулы (Rast et al., 1994).

В кластерах этого типа V и J, J и C генные сегменты разделены, как и в

кластерах первого типа, примерно 0,5 и 4 тпн соответственно. V и J генные

сегменты фланкируются сайтами специфической рекомбинации со спейсерами 12 и

23 пн, что соответствует конфигурации спейсеров в локусах каппа типа

млекопитающих. По первичной структуре гены третьего типа тоже наиболее

близки к генам каппа типа высших позвоночных (гомология по аминокислотной

последовательности составляет около 60%).

Гены этих трех типов имеют между собой низкую степень гомологии:40-

50% по нуклеотидной последовательности С сегментов и 50-60% по

последовательности V сегментов (Hohman et al., 1993).

Полученные данные показывают, что у хрящевых рыб имеется очень

большое количество генных сегментов. Однако специфика организации генов

исключает комбинативное сочетание сегментов. Все разнообразие антител у

хрящевых рыб формируется только за счет экспрессии большого количества

кластеров.

Данные о нуклеотидных последовательностях из разных локусов выявили

низкую гетерогенность генов (85-95%), что указывает на отсутствие

соматического мутагенеза (Rast et al., 1994).

Костистые рыбы.

Анализ сывороточных антител пещерного сомика (Ictalurus punctatus)

показал наличие трех типов L-цепей с различными молекулярными массами: 26,

24 и 22 кДа. Два вида антител мыши, 3F12 и 1G7, захватывают более 90% от

общего количества иммуноглобулинов в реакции иммунопреципитации. При этом

3F12 антитела связываются с молекулами, содержащими L-цепи массой 24 и 22

кДа, а 1G3 антитела с другой субпопуляцией, содержащей L-цепи массой 26

кДа. На основе этих данных L-цепи разделяют на два класса, называемые F и G

(Lobb et al.,1984).

Геномная организация локуса L-цепей G типа имеет кластерный тип (рис.

5). В каждом кластере содержится по одному J и C сегменту и два V сегмена.

Вариабельные генные сегменты расположены всегда в противоположной

транскрипционной полярности к J и C сегментам . В ряде геномных клонов один

V сегмент располагался с 3' стороны от C генного сегмента. Размер кластера

равен примерно 3 тпн, расстояние между кластерами около 6 тпн (Ghaffari and

Lobb, 1993; Bengten, 1994).

Хотя гены L-цепей сомика имеют низкую гомологию с генами других

позвоночных (40-50% по нуклеотидной последовательности), их можно отнести к

каппа типу высших позвоночных, так как сходство по первичной структуре с

лямбда типом ниже. Кроме того, конфигурация спейсеров имеет характер каппа

типа: 12 пн спейсер ассоциирован с V, 23 пн спейсер с J сегментом (Ghaffari

and Lobb, 1993).

У радужной форели (Oncorhynchus mykiss), представителя другого

семейства костистых рыб, также обнаружены два типа L цепей (Daggfeldt et

al., 1993). Один из них (L1) высокогомологичен G типу сомика по структуре V

Страницы: 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8



2012 © Все права защищены
При использовании материалов активная ссылка на источник обязательна.